金针菇长得不整齐，主要是出菇期管理不当造成的。以下为合理的管理措施：

　　1.蕾期。采取催蕾管理措施，将菇房门窗打开，增强光照和通风，向空间喷雾状水，使菇房空气相对湿度增高到90%左右，降温至10℃左右，同时松动袋口，以诱发菇蕾的发生，但这时一定不能把袋口的塑料薄膜全部撑开，以防培养料水分蒸发，影响菇蕾形成。几天后，当培养料面出现棉花状菌丝或黄色水珠时，将袋口敞开，经过1周左右，陆续长出针头状的菇蕾。

　　2.驯养期。当子实体长到1厘米左右时，要减少或停止喷水，湿度控制在75%左右。通风降温，将温度调节在5℃左右。驯养后，恢复并保持菇房的温度在10℃左右，即可促进子实体生长。

　　3.伸长期。要采取措施促使菌柄迅速伸长。(1)套筒与拉直袋口。当子实体长到2～3厘米时，应把塑料袋口多余的薄膜撑开，提升拉直，这样可以限制供氧，增高二氧化碳浓度，目的是抑制菌盖开伞，促使菌柄伸长。(2)调温。将温度控制在10℃左右。(3)增湿。空气相对湿度应保持在85～90%，菇房内应喷水保湿，喷水量随子实体生长而增加。(4)弱光诱导。在两排床架正中上方，每隔3～5米安装1只15瓦灯泡，产生垂直光，诱导子实体成束地伸向光源的方向，促使菌柄伸长。(5)调控二氧化碳浓度。通过减少通风次数和时间，使菇房空气中的二氧化碳浓度保持在0.1%～0.15%。通过以上管理措施，大概15天之后，就可生产出菌盖直径1厘米左右，菌柄长度8～15厘米商品性较好的金针菇产品。